我可以从 R 中的布雷柯蒂斯矩阵中提取某些相异值吗？

Question

我正在尝试评估入侵物种清除后河流群落的变化持续多长时间。在移除之前和移除之后的几个时间点对社区进行了一系列评估。我想计算社区在移除之前和移除后的每个时间点（即前后 1、前后 2、前后 3 等）之间的差异，然后跨时间分析这些值以确定多长时间溪流社区需要恢复到搬迁前的条件。预计流参数的差异会影响该过程，因此我需要按流来执行此操作。我在 x 轴上描绘了一个时间图，在 y 轴上描绘了不同程度，并且每个流都有不同的函数。有没有办法从布雷柯蒂斯矩阵中提取这些差异值？

这是我的第一个问题，对于任何遗漏的信息或不清楚的地方，我深表歉意。

Answer 1

如果您将输出从 vegdist() 转换为矩阵，那么您可以轻松地提取样本对之间的差异，使用行名或矩阵的索引来提取您想要的内容。

要转换为矩阵使用

distmat <- as.matrix(bc_obj)

其中bc_obj 是从vegdist() 返回的包含布雷柯蒂斯距离的对象。