R 脚本在本地机器上成功运行，而不是在 EC2 实例上答案

【问题标题】：R Script running successfully on local machine, not on EC2 instanceR 脚本在本地机器上成功运行，而不是在 EC2 实例上
【发布时间】：2019-02-13 04:49:34
【问题描述】：

我有一个 R 脚本（一个 R 管道工 API），已部署到 EC2 实例并使用 pm2 进行管理，但我遇到了一个棘手的问题。我已经查明了错误的确切位置，希望能更好地理解这个错误。

当我在本地机器（Mac 上的 RStudio）上运行脚本时，它可以正常工作。当我从 EC2 实例命令行使用 Rscript myrfile.R 运行脚本时，它会中断。

我已经指出，在 EC2 实例上破坏脚本的代码行及其错误是：

my_df <- my_df %>%
  dplyr::mutate(AwayScore = ifelse(dplyr::row_number() == 1, 0, AwayScore),
                HomeScore = ifelse(dplyr::row_number() == 1, 0, HomeScore)) 

# with the following error
<Rcpp::eval_error in mutate_impl(.data, dots): Evaluation error: argument "x" is missing, with no default.>

我 100% 确定 dplyr 已安装在 EC2 实例上，因为我的脚本自始至终都在使用它。我也 100% 确定这里的 my_df 数据框有 AwayScore 和 homeScore 列，而且 my_df 没有任何其他问题。

我只能假设这个错误是由 dplyr::row_number() 函数引起的，EC2 实例似乎无法处理该函数，尽管我对此并不肯定。

任何想法/帮助/我应该尝试/等的事情将不胜感激，谢谢！！

【问题讨论】：

标签： r amazon-ec2 dplyr plumber

【解决方案1】：

我很容易将代码更改为以下内容：

  if(is.na(my_df$AwayScore[1])) { my_df$AwayScore[1] = 0 }
  if(is.na(my_df$HomeScore[1])) { my_df$HomeScore[1] = 0 }

...所以我可能不会浪费太多时间来调试它。

【讨论】：

【解决方案2】：

虽然我感谢您通过不需要库避免了该问题，但在某些时候您可能会发现您希望以类似的方式运行代码，此时需要加载库。

我在使用 R 脚本时遇到了类似的问题。我发现它找不到我安装的库。可以使用 R.exe 代替 Rscript.exe，但这会引起其他麻烦。发现使用Rscript时的环境不包含R_LIBS_USER路径

如果您将以下代码附加到 R 脚本的顶部，它应该可以工作

p <- "\directory path of local R packages"

.libPaths(c(p,.libPaths()))

将文件夹路径放在计算机上找到您的库的位置。如果在 GUI 中运行 R，这是 Sys.getenv("R_LIBS_USER") 返回的路径

【讨论】：

我认为我的 R 脚本在查找包时没有问题。它能够加载和使用我的脚本所需的所有其他库（包括其他地方的 dplyr）
我认为是当您从控制台使用 Rscipt 运行脚本时。至少这对我来说是过去的问题。
刚刚在我的笔记本电脑上测试了 Rscript，它似乎知道本地库路径是什么，并且能够从中加载库：所以我可能弄错了。