为什么 knitr 缓存对 data.table `:=` 失败？

Question

这在精神上与this问题有关，但在机制上必须不同。

如果您尝试缓存包含data.table := 分配的knitr 块，那么它就好像该块尚未运行，并且以后的块看不到:= 的影响。

知道这是为什么吗？ knitr 是如何检测对象更新的，data.table 做了什么让它感到困惑？

看来您可以通过 DT = DT[, LHS:=RHS] 解决此问题。

示例：

```{r}
library(data.table)
```
Data.Table Markdown
========================================================
Suppose we make a `data.table` in **R Markdown**
```{r, cache=TRUE}
DT = data.table(a = rnorm(10))
```
Then add a column using `:=`
```{r, cache=TRUE}
DT[, c:=5] 
```
Then we display that in a non-cached block
```{r, cache=FALSE}
DT
```
The first time you run this, the above will show a `c` column, 
from the second time onwards it will not.

第二次运行的输出

Answer 1

正如 Josh O'Brien 回答下的第四条评论所示，我添加了一个新的块选项 cache.vars 来处理这种非常特殊的情况。在第二个缓存块中，我们可以指定cache.vars='DT'，以便knitr 将保存DT 的副本。

```{r}
library(data.table)
```
Data.Table Markdown
========================================================
Suppose we make a `data.table` in **R Markdown**
```{r, cache=TRUE}
DT = data.table(a = rnorm(10))
```
Then add a column using `:=`
```{r, cache=TRUE, cache.vars='DT'}
DT[, c:=5] 
```
Then we display that in a non-cached block
```{r, cache=FALSE}
DT
```

无论编译多少次，输出都是这样的：

Answer 2

推测：

这似乎是正在发生的事情。

knitr 非常明智地在对象创建后立即对其进行缓存。然后，只要检测到它们已被更改，它就会更新它们的缓存值。

但是，

data.table 绕过了 R 的常规按值复制分配和替换机制，并使用 := 运算符而不是 =、<<- 或 @987654325 @。因此，knitr 没有接收到 DT 已被 DT[, c:=5] 更改的信号。

解决方案：

只需将此块添加到您希望重新缓存DT 的当前值的任何位置。它不会花费你任何内存或时间（因为除了引用之外什么都不会被DT <- DT 复制），但它确实向 knitr 发送了一个（假）信号 DT 已经更新：

```{r, cache=TRUE, echo=FALSE}
DT <- DT 
```

---

示例文档的工作版本：

通过运行您的文档的此编辑版本来检查它是否有效：

```{r}
library(data.table)
```
Data.Table Markdown
========================================================
Suppose we make a `data.table` in **R Markdown**
```{r, cache=TRUE}
DT = data.table(a = rnorm(10))
```

Then add a column using `:=`
```{r, cache=TRUE}
DT[, c:=5] 
```

```{r, cache=TRUE, echo=FALSE}
DT <- DT 
```

Then we display that in a non-cached block
```{r, cache=FALSE}
DT
```
The first time you run this, the above will show a `c` column. 
The second, third, and nth times, it will as well.