如何在 data.table 中使用 fread() 指示 row.names=1？答案

【问题标题】：How to indicate row.names=1 using fread() in data.table?如何在 data.table 中使用 fread() 指示 row.names=1？
【发布时间】：2014-08-16 23:41:04
【问题描述】：

我想将 .csv 文件中的第一列视为行名序列。通常我会这样做：

read.csv("example_file.csv", row.names=1)

但我想使用data.table R 包中的fread() 函数来执行此操作，因为它运行得非常快。

【问题讨论】：

不要在 data.table 中使用行名。只需将它们作为一列。
如果您想在fread 之后转换为data.frame，只需使用data.frame(fread("example_file.csv"), row.names=1)。但我建议改用data.table。
但是我剩下的列是数字的，我想对它们应用一些函数。我希望这些只是行名，并打算使用 data.table 而不是 data.frame 这就是问题所在
@MattDowle 我认为这里有一些有效性，如果有人想将结果对象用作矩阵，而不是 data.frame/data.table。我正在处理一些我想应用矩阵数学的数据，并且更愿意使用 fread 来提高速度。目前我正在使用data.matrix(read.csv("myfile.csv", row.names = 1))。
@dayne bigmemory::read.big.matrix 是否比 read.csv 快并且足够快？如果没有，请在 github 跟踪器上提交功能请求 - 谢谢。

标签： r data.table

【解决方案1】：

根据我所做的一个小搜索，data.tables never uses row names. Since data.tables inherit from data.frames, it still has the row names attribute. But it never uses them。

但是，您可能可以使用this answer (similar post)，然后将行名列设置为您的实际行名。虽然，它可能效率不高。

【讨论】：

【解决方案2】：

为什么不在列中保存行名：

df <- data.frame(x=rnorm(1000))
df$row_name = row.names(df)   
fwrite(df,file="example_file.csv")

然后您可以加载保存的 CSV。

df <- fread(file="example_file.csv")

【讨论】：

【解决方案3】：

只有一个函数，转换为数据框

a <- fread(file="example_file.csv")  %>% as.data.frame()
row.names(a) <- a$V1

【讨论】：

【解决方案4】：

X <- as.matrix(fread("bigmatrix.csv"),rownames=1)

【讨论】：