为 R 的 glmnet 正确格式化数据的问题答案

【问题标题】：Issues with getting data formatted correctly for R's glmnet为 R 的 glmnet 正确格式化数据的问题
【发布时间】：2015-01-28 14:10:27
【问题描述】：

我正在尝试使用 glmnet 拟合泊松模型，但我似乎无法正确获取正确格式的数据。所有变量都是分类的。这是处理几乎相同问题的较早问题，但给出的解决方案对我没有帮助 - as.matrix() 和 model.matrix 只是抛出了更多错误消息。

对于as.matrix，这是我得到的：

x<-as.matrix(ld2)

> res<-glmnet(x,y,family = "poisson")
Error in fishnet(x, is.sparse, ix, jx, y, weights, offset, alpha, nobs,  : 
  NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 4)

In addition: Warning message:
In fishnet(x, is.sparse, ix, jx, y, weights, offset, alpha, nobs,  :
  NAs introduced by coercion

有什么想法吗？

【问题讨论】：

什么是Id2？一个可重现的例子会很有帮助
您能否根据尝试x <- model.matrix(~.,data=ld2) 显示结果/错误？
具有自变量的数据框，我试图将其转换为矩阵形式以输入到 glmnet。可重现，你的意思是小到可以张贴在这里的东西吗？没问题。
Ben，这似乎奏效了，谢谢！你能告诉我“~”是什么吗？做？这是我第一次处理矩阵，显然我很好奇。

标签： r glmnet

【解决方案1】：

你应该试试

x <- model.matrix(~.,data=ld2)

model.matrix() 是将数据框（包含数字和分类预测变量）转换为数字模型矩阵的 R 函数；分类预测变量变成了二进制虚拟预测变量集。公式~.，特别是点，表示“使用数据框中的所有变量作为主效应”（这是一个单边公式——无需在左侧指定响应变量~)。

【讨论】：