无法在 RHEL6 上的 R 中安装 rgdal 包，无法加载共享对象 rgdal.so答案

【问题标题】：Cannot install rgdal package in R on RHEL6, unable to load shared object rgdal.so无法在 RHEL6 上的 R 中安装 rgdal 包，无法加载共享对象 rgdal.so
【发布时间】：2017-03-11 08:19:52
【问题描述】：

我有安装（编译）rgdal 1.9.2 和 proj 软件包的 AWS RHEL6 服务器。现在在 R 中我想安装 rgdal 包，但它给出了这个错误：

** 测试安装的包是否可以加载
dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) 中的错误：
无法加载共享对象'/home/Roel/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.3/rgdal/libs/rgdal.so'：
libgdal.so.1：无法打开共享对象文件：没有这样的文件或目录错误：加载失败
执行停止
错误：加载失败
* 删除‘/home/Roel/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.3/rgdal’ install.packages 中的警告：
安装包“rgdal”的退出状态非零

完整的安装日志可以在here找到。

当我在 Linux 中找到 rgdal.so 时，它什么也找不到。我也找不到如何获取 rgdal.so 的一部分。

有人知道如何解决这个问题吗？

【问题讨论】：

读过这个？ stackoverflow.com/questions/15248815/rgdal-package-installation
是的，我在这个问题之前遇到过这个问题，但设法解决了。
对我来说确切的错误是，在安装rgdal 期间是unable to load shared object '/home/<username>/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.3/rgdal/libs/rgdal.so':，后跟libgdal.so.20: cannot open shared object file: No such file or directory。 @RoelEselink 的答案是解决方案。

标签： r linux rhel rhel6 rgdal

【解决方案1】：

我修好了：

日志中还有一个错误，由于最后的错误，我错过了：

./proj_conf_test: error while loading shared libraries: libgdal.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory

libgdal.so.1 在 /usr/local/lib 中的系统上。

然后我做了：

echo "/usr/local/lib" >> /etc/ld.so.conf.d/R-dependencies-x86_64.conf
ldconfig

这修复了我在 OP 中提到的后续错误。

【讨论】：

如果您的权限被拒绝，请参阅下面@user3342735 的答案。

【解决方案2】：

如果您在运行 Roel's 时看到 Permission Denied，请尝试：

sudo ldconfig -c "echo '/usr/local/lib' >> /etc/ld.so.conf.d/R-dependencies-x86_64.conf"

【讨论】：

另外你可能需要 lib64 而不是 lib。