我想知道您是否可以从他们的任何公共 API 中获取相同的数据。如果您只是想要一个包含该表的 pdf(以及许多其他有用信息表),您可以使用 API 进行提取。
如果您想要作为 DataFrame(类似于网页),您可以编写一个用户定义的函数,在 pdftools 的帮助下,从 pdf 中重建表格。付出更多的努力,但由于您已经使用rvest 获得了其他答案,我想我会看看这个。我查看了tabularize,但这并不是特别有效。
很有可能,您可以将几个 API 数据集放在一起以获得完整内容,而无需解析我使用的 pdf 出版物,例如有一个 Excel 电子表格提供案例编号。
注意网页中有一些底部计算未包含在下面。我只处理了pdf中的测试信息表。
报道记者:
https://data.public.lu/en/datasets/covid-19-rapports-journaliers/#_
https://download.data.public.lu/resources/covid-19-rapports-journaliers/20211210-165252/coronavirus-rapport-journalier-10122021.pdf
API 数据集:
https://data.public.lu/api/1/datasets/#
library(tidyverse)
library(jsonlite)
## https://data.library.virginia.edu/reading-pdf-files-into-r-for-text-mining/
# install.packages("pdftools")
library(pdftools)
r <- jsonlite::read_json("https://data.public.lu/api/1/datasets/#")
report_index <- match(TRUE, map(r$data, function(x) x$slug == "covid-19-rapports-journaliers"))
latest_daily_covid_pdf <- r$data[[report_index]]$resources[[1]]$latest # coronavirus-rapport-journalier
filename <- "covd_daily.pdf"
download.file(latest_daily_covid_pdf, filename, mode = "wb")
get_latest_daily_df <- function(filename) {
data <- pdf_text(filename)
text <- data[[1]] %>% strsplit(split = "\n{2,}")
web_data <- text[[1]][3:12]
df <- map(web_data, function(x) strsplit(x, split = "\\s{2,}")) %>%
unlist() %>%
matrix(nrow = 10, ncol = 5, byrow = T) %>%
as_tibble()
colnames(df) <- text[[1]][2] %>%
strsplit(split = "\\s{2,}") %>%
map(function(x) gsub("(.*[a-z])\\d+", "\\1", x)) %>%
unlist()
title <- text[[1]][1] %>%
strsplit(split = "\n") %>%
unlist() %>%
tail(1) %>%
gsub("\\s+", " ", .) %>%
gsub(" TOTAL", "", .)
colnames(df)[2:3] <- colnames(df)[2:3] %>% paste(title, ., sep = " ")
colnames(df)[4:5] <- colnames(df)[4:5] %>% paste("TOTAL", ., sep = " ")
colnames(df)[1] <- "Metric"
clean_col <- function(x) {
gsub("\\s+|,", "", x) %>% as.numeric()
}
clean_col2 <- function(x) {
gsub("\n", " ", gsub("([a-z])(\\d+)", "\\1", x))
}
df <- df %>% mutate(across(.cols = -c(colnames(df)[1]), clean_col),
Metric = clean_col2(Metric)
)
return(df)
}
View(get_latest_daily_df(filename))
输出:
替代:
如果您只是想提取项目然后进行处理,您可以将每一列提取为列表中的一个项目。替换 br 元素,使其中的内容以逗号分隔的列表结尾:
library(rvest)
library(magrittr)
library(stringi)
library(xml2)
page <- read_html("https://covid19.public.lu/en.html")
xml_find_all(page, ".//br") %>% xml_add_sibling("span", ",") #This method from https://stackoverflow.com/a/46755666 @hrbrmstr
xml_find_all(page, ".//br") %>% xml_remove()
columns <- page %>% html_elements(".cmp-gridStat__item")
map(columns, ~ .x %>%
html_elements("p") %>%
html_text(trim = T) %>%
gsub("\n\\s{2,}", " ", .)
%>%
stri_remove_empty())