从另一个包扩展 S4 类：reconcilePropertiesAndPrototype 错误答案

【问题标题】：Extending a S4 class from another package: reconcilePropertiesAndPrototype error从另一个包扩展 S4 类：reconcilePropertiesAndPrototype 错误
【发布时间】：2019-03-06 12:08:47
【问题描述】：

我正在尝试为RJDBC::JDBCConnection 编写一个子类，因为我需要使用dplyr#2941（最初为from here）的方法来连接dbplyr 包的自定义方法。但是，我并没有覆盖*.JDBCConnection 方法，而是想为JDBCConnection 的子类编写方法。

因此，根据this Stack Overflow question 的建议，我编写了我的包，基本上是这样的：

### R/testclass.R ####################
#' Test class
#'
#' This extends JDBCConnection in package RJDBC
#'
#' @import RJDBC
#'
setClass("TestConnection", contains = "JDBCConnection")

### DESCRIPTION ######################
Package: test
Type: Package
Title: What the Package Does (Title Case)
Version: 0.1.0
Author: Who wrote it
Maintainer: The package maintainer <yourself@somewhere.net>
Description: More about what it does (maybe more than one line)
    Use four spaces when indenting paragraphs within the Description.
License: What license is it under?
Encoding: UTF-8
LazyData: true

我要扩展的类已经存在，可以通过help("JDBCConnection-class", package = "RJDBC")查看。

在此包中调用 devtools::document() 会返回以下错误：

Updating test documentation
Loading test

Error in reconcilePropertiesAndPrototype(name, slots, prototype, superClasses,  : 
no definition was found for superclass "JDBCConnection" in the specification of class "TestConnection"

我也试过用@importClassesFromas per this SO question替换@import，但结果是一样的。

如何让document() 运行？

【问题讨论】：

标签： r extends s4 roxygen dbplyr

【解决方案1】：

你还需要添加

Imports: RJDBC

到您的DESCRIPTION 文件。例如，请参阅this guide：

如果您的包正在使用其他包中的功能，您还需要在您的说明文件中添加一些行。

...

Imports 用于您的包需要的包，但不需要用 library() 加载。中提到的包 Roxygen2 cmets 中的 @import 或 @importFrom 语句，或者函数是通过 :: 运算符访问的，应该在这里。

在那之后，你的包裹document()对我来说没问题。

【讨论】：

【解决方案2】：

当我不依赖roxygen2 编写我的DESCRIPTION 文件而是自己添加包时，我成功记录了包。 NAMESPACE 由 roxygen2 管理。

如果我添加线

Imports: methods, RJDBC

或

Depends: RJDBC

手动到DESCRIPTION 文件，devtools::document() 运行没有错误。

[duckmayr 在同一时间发现了它]

【讨论】：