Rmarkdown 在父目录中渲染 index.html 而不是渲染打开的文档答案

【问题标题】：Rmarkdown renders index.html in parent directory instead of rendering the opened documentRmarkdown 在父目录中渲染 index.html 而不是渲染打开的文档
【发布时间】：2021-12-27 16:10:56
【问题描述】：

我在 bookdown 目录中有一个包含幻灯片的目录，如下所示。

docs
slides/01_slide.Rmd
slides/_output.yml
01_chapter.Rmd
_bookdown.yml
_output.yml
index.Rmd
...

我想使用slides/_output.yml 构建slides/01_slide.Rmd。当我在 RStudio 中打开 slides/01_slide.Rmd 并点击 Knit 按钮时，index.Rmd 被渲染，而我实际打开的文件根本没有被使用。

==> rmarkdown::render_site('…/slides/01_slide.Rmd',  encoding = 'UTF-8');


processing file: bookdown.Rmd
  |......................................................................| 100%
   inline R code fragments


…
output file: bookdown.knit.md


Output created: docs/index.html

Output created: …/docs/index.html

当我将 index.Rmd 重命名为其他名称时，slides/01_slide.Rmd 会正确呈现。

有没有办法强制 Knit 按钮呈现实际打开的文档，而不是从父目录中查找输入？

我知道我可以在 YAML 中添加 knit: rmarkdown::render 并为每个幻灯片文档单独编写参数，但这比不断重命名 index.html 更麻烦。

（我将幻灯片保存在 bookdown 目录中的原因是我想将整个项目托管在 Github 存储库中，同时提供来自 /docs 的 bookdown 输出。）

【问题讨论】：

标签： r r-markdown bookdown

【解决方案1】：

问题可以通过在 YAML 中只添加 knit: rmarkdown::render 来解决。然后 Knit 按钮触发 render 而不是 render_site。该函数不需要额外的参数，并且还应用了slides/_output.yml。

【讨论】：