从R中的多个文件夹中提取文件答案

【问题标题】：Extract files from multiple folders in R从R中的多个文件夹中提取文件
【发布时间】：2023-02-05 21:12:17
【问题描述】：

我有一个充满文件夹的目录，在每个文件夹中都有一个 .tsv 文件，我需要将其提取到不同的目录（以便文件夹中的所有文件都在一个文件夹中）

我的想法是在 R 中编写一个 for 循环，它会得到一个包含根目录中所有文件的列表，打开这些文件，将 .tsv 文件复制到新位置

它看起来像这样：

Files <- list.files("directory")
directory1 <- "root directory"
directory2 <- "place they need to go"
for (i in files){
file.copy(from = directory1,
          to = directory2)}

然而，这是行不通的。

【问题讨论】：

您只是将目录/文件路径放在 file.copy() 命令中，而不是文件名本身。您的循环有错误，因为您定义了 i 但根本没有在循环中使用它。您可能想在循环中尝试使用 ..(from = paste0(directory1, i, ....)（但请确保 directory1 末尾有一个 /）。

标签： r

【解决方案1】：

您没有在循环中使用 i，所以这是问题的一部分。尝试

for (i in files){
  file.copy(from = file.path(directory1, i),
            to = file.path(directory2, i))
}

【讨论】：

这没有用，我认为必须有一种方法来指定必须移动的文件
“没有工作”是什么意思？你收到错误了吗？该文件是否未出现在新位置？还是您想移动它而不是复制它？如果要移动文件，还有 file.rename 而不是 file.copy。
该文件确实没有出现在新位置。抱歉不确定
您的代码中同时包含 "directory" 和 "root directory"。这些路径是否相同？如果该文件不存在，我希望您会得到一个错误。 length(Files) 返回什么。您确定列表中有文件吗？
不，这些路径不一样，lenght files 返回 5。这是正确的，因为有 5 个文件夹包含文件（在本例中）

【解决方案2】：

虽然现在可能已经晚了，但解决方案是在 list.files() 函数中指定 recursive= 和 full.names= 参数。

之后，您可以在不使用循环的情况下复制文件：

Files <- list.files("directory", recursive=TRUE, full.names=TRUE) 
new_directory <- "place they need to go"
file.copy(from=Files, to="new_directory")

【讨论】：