爆炸不适用于熊猫数据框答案

【问题标题】：Explode is not working on pandas dataframe爆炸不适用于熊猫数据框
【发布时间】：2023-01-19 17:21:45
【问题描述】：

我有一个包含以下列的数据框

col1 col2       col3            col4            col5
0   HP:0005709  ['HP:0001770']  Toe syndactyly  SNOMEDCT_US:32113001, C0265660
1   HP:0005709  ['HP:0001780']  Abnormality of toe  C2674738
2   EFO:0009136 ['HP:0001507']  Growth abnormality  C0262361

我想爆炸“col4”，我尝试了不同的方法，但没有任何效果。该列的 dtype 是“object”。

我的尝试如下：

df.explode('cross_ref')
df['cross_ref']=df['cross_ref'].str.split(',') df = df.set_index(['col2']).apply(pd.Series.explode).reset_index()

import ast df[['cross_ref']] = df[['cross_ref']].applymap(ast.literal_eval) df = df.apply(pd.Series.explode)

预期的输出是：

col1 col2       col3            col4                col5
0   HP:0005709  ['HP:0001770']  Toe syndactyly      SNOMEDCT_US:32113001
0   HP:0005709  ['HP:0001770']  Toe syndactyly      C0265660
1   HP:0005709  ['HP:0001780']  Abnormality of toe  C2674738
2   EFO:0009136 ['HP:0001507']  Growth abnormality  C0262361

【问题讨论】：

爆炸col5？ col5 是一个列表吗？试试df.explode('col5')
请重新格式化您的数据框或提供数据框构造函数。 cross_ref栏是col5但是你想爆col4？？？

标签： python pandas dataframe split explode

【解决方案1】：

您的输入数据令人困惑，因为它只有 4 列有 5 个标题（或者索引是“正常”列？）。为了爆炸col4首先拆分它以将其元素转换为列表，然后爆炸：

df['col4'] = df['col4'].str.split(',s*', regex=True)
df = df.explode('col4')

输出：

          col1            col2                col3                  col4
0   HP:0005709  ['HP:0001770']      Toe syndactyly  SNOMEDCT_US:32113001
0   HP:0005709  ['HP:0001770']      Toe syndactyly              C0265660
1   HP:0005709  ['HP:0001780']  Abnormality of toe              C2674738
2  EFO:0009136  ['HP:0001507']  Growth abnormality              C0262361

【讨论】：

【解决方案2】：

IIUC，尝试：

out = df.assign(**{'col5': df['col5'].str.split(', ')}).explode('col5')
print(out)

# Output
   col1         col2            col3                col4                  col5
0     0   HP:0005709  ['HP:0001770']      Toe syndactyly  SNOMEDCT_US:32113001
0     0   HP:0005709  ['HP:0001770']      Toe syndactyly              C0265660
1     1   HP:0005709  ['HP:0001780']  Abnormality of toe              C2674738
2     2  EFO:0009136  ['HP:0001507']  Growth abnormality              C0262361

【讨论】：