计算香农多样性指数误差

Question

尝试使用 R 的素食包计算香农多样性指数时，我不断收到以下错误： 多样性错误（div.site，index =“shannon”，MARGIN = 1，base = exp（1））： 输入数据必须是数字

这是我的代码：

div.site<-read.csv("POLL.DIV.SITE.csv")
diversity(div.site, index = "shannon", MARGIN = 1, base = exp(1))
fisher.alpha(x, MARGIN = 1, ...)
specnumber(div.site, groups, MARGIN = 1)

Answer 1

只需删除所有非数字列。您不需要名称和站点来计算香农指数。确保“计数”列是数字而不是向量。