从 anndata .obs 和 .x 中删除样本

【问题标题】：remove sample from anndata .obs and .x从 anndata .obs 和 .x 中删除样本
【发布时间】：2022-11-22 15:13:33
【问题描述】：

我可以看到如何从 anndata 中删除列，即

keep = ['a','b','c']

adata = adata [:, keep]

如何从 anndata.obs 和 anndata.x 中删除行？

例如删除 adata.obs[Region='reg012']

adata.obs

【问题讨论】：

标签： python

【解决方案1】：

如果你想删除行 if Region contians reg012 then..

假设Data Frame = adata.obs

adata.obs= adata.obs[~adata.obs.Region.str.contains("reg012")]

【讨论】：

【解决方案2】：

您可以根据条件使用drop：

adata = adata.drop(adata.loc[adata["Region"]=='reg012'])

【讨论】：