在 R 中的 CytoTree 中创建 CYT 对象答案

【问题标题】：Create CYT object in CytoTree in R在 R 中的 CytoTree 中创建 CYT 对象
【发布时间】：2022-09-30 05:24:28
【问题描述】：

我想在 R 中创建一个 CytoTree CYT 对象来分析我的 .FCS 文件。当我在包描述中使用快速启动代码时，在运行 createCYT() 函数时总是会收到错误消息：

createCYT(raw.data = fcs.data, normalization.method = \"log\") 中的错误： 2022-09-26 15:46:26 meta.data 必须是 data.frame

由于该函数不应依赖任何元数据并且该对象是可选的，因此我不知道如何解决该错误。

这是描述：

非常感谢您的帮助！

【解决方案1】：

我以前遇到过同样的问题。最后，它仅在添加数据框时才起作用（是的，即使它不应该依赖它）。方法如下：

meta.data <- data.frame(cell = rownames(fcs.data), stage = gsub(".fcs.+", "", rownames(fcs.data)))

meta.data$stage <- factor(as.character(meta.data$stage))

希望这可以帮助。

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