【发布时间】：2022-08-24 19:55:34
【问题描述】：
我有一个相当有趣的问题，我找不到答案。我正在使用 RStudio Server (v. 1.4.1717)，并且安装了 R 版本 4.1.0。我尝试将 Projects 与 renv 一起使用，到目前为止它还不错，即使我在偶尔安装库时遇到问题。
但是，现在我不断收到此错误：
Error: package ‘xxx’ required by ‘yyy’ could not be found
我已经尝试了几件事。我尝试将.libPaths() 更改为新位置，重新安装每个库，但这并没有解决我的问题。我也尝试在项目内部和外部执行此操作（因此，renv 也处于活动状态和禁用状态），但我一直遇到同样的问题。举个例子：
>BiocManager::install(\"MatrixGenerics\", lib = \"/media/erkin/lib\")
getOption(\"repos\")\' replaces Bioconductor standard repositories, see \'?repositories\' for details
replacement repositories:
CRAN: https://packagemanager.rstudio.com/all/__linux__/focal/latest
Bioconductor version 3.14 (BiocManager 1.30.18), R 4.1.0 (2021-05-18)
Installing package(s) \'MatrixGenerics\'
trying URL \'https://bioconductor.org/packages/3.14/bioc/src/contrib/MatrixGenerics_1.6.0.tar.gz\'
Content type \'application/x-gzip\' length 28270 bytes (27 KB)
==================================================
downloaded 27 KB
* installing *source* package ‘MatrixGenerics’ ...
** using staged installation
** R
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
Error: package ‘matrixStats’ required by ‘MatrixGenerics’ could not be found
Execution halted
ERROR: lazy loading failed for package ‘MatrixGenerics’
* removing ‘/media/erkin/lib/MatrixGenerics’
The downloaded source packages are in
‘/tmp/RtmpgabWCB/downloaded_packages’
Warning message:
In install.packages(...) :
installation of package ‘MatrixGenerics’ had non-zero exit status
我已经安装了matrixStats，我可以调用它。如果我检查sessionInfo()：
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 20.04.2 LTS
Matrix products: default
BLAS/LAPACK: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/openblas-pthread/libopenblasp-r0.3.8.so
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8
[5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=C LC_PAPER=en_US.UTF-8 LC_NAME=C
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] matrixStats_0.62.0 BiocGenerics_0.40.0
loaded via a namespace (and not attached):
[1] BiocManager_1.30.18 compiler_4.1.0 tools_4.1.0
这不是唯一发生这种情况的包。我尝试安装的许多其他软件包（例如S4Vectors 安装找不到BiocGenerics、BiocStyle 安装说没有名为BiocManager 的软件包）只是一直失败。
我可能遗漏了一些东西，有人知道为什么我的 R 无法找到已安装的软件包来安装新软件包吗？
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find.package(\"matrixStats\")的输出是什么？它是偶然安装到单独的库路径中的吗？ -
非常感谢您的回复@KevinUshey，我现在已经通过安装 tidyverse 和 dplyr 及其依赖项解决了这个问题......我不确定这是如何相关的，以及它如何解决找不到已经存在的库的问题安装，但不知何故它现在工作。我将尝试重新创建问题，看看
find.package()是否给我提供了与预期不同的输出。 -
我设法通过使用新的 renv 库以及干净的基础库（我的意思是，renv 之前的默认库路径没有用户安装的库）来重新创建问题。这是
find.package(\"matrixStats\")的输出：> find.package(\"matrixStats\") [1] \"/home/ilacar/test_project/library_test/renv/library/R-4.1/x86_64-pc-linux-gnu/matrixStats\" > .libPaths() [1] \"/home/ilacar/test_project/library_test/renv/library/R-4.1/x86_64-pc-linux-gnu\" [2] \"/usr/local/lib/R/library\"
标签： r failed-installation r-library