【问题标题】:Spark: error reading DateType columns in partitioned parquet dataSpark:读取分区拼花数据中的 DateType 列时出错
【发布时间】:2017-04-29 05:39:36
【问题描述】:

我在 S3 中有镶木地板数据,按 nyc_date 分区,格式为 s3://mybucket/mykey/nyc_date=Y-m-d/*.gz.parquet

我有一个 DateType 列 event_date,当我尝试从 S3 读取并使用 EMR 写入 hdfs 时,由于某种原因会引发此错误。

from pyspark.sql import SparkSession

spark = SparkSession.builder.enableHiveSupport().getOrCreate()
df = spark.read.parquet('s3a://mybucket/mykey/') 

df.limit(100).write.parquet('hdfs:///output/', compression='gzip')

错误:

java.lang.UnsupportedOperationException: org.apache.parquet.column.values.dictionary.PlainValuesDictionary$PlainBinaryDictionary
    at org.apache.parquet.column.Dictionary.decodeToInt(Dictionary.java:48)
    at org.apache.spark.sql.execution.vectorized.OnHeapColumnVector.getInt(OnHeapColumnVector.java:233)
    at org.apache.spark.sql.catalyst.expressions.GeneratedClass$GeneratedIterator.processNext(Unknown Source)
    at org.apache.spark.sql.execution.BufferedRowIterator.hasNext(BufferedRowIterator.java:43)
    at org.apache.spark.sql.execution.WholeStageCodegenExec$$anonfun$8$$anon$1.hasNext(WholeStageCodegenExec.scala:370)
    at scala.collection.Iterator$$anon$10.hasNext(Iterator.scala:389)
    at scala.collection.Iterator$$anon$11.hasNext(Iterator.scala:408)
    at org.apache.spark.shuffle.sort.BypassMergeSortShuffleWriter.write(BypassMergeSortShuffleWriter.java:125)
    at org.apache.spark.scheduler.ShuffleMapTask.runTask(ShuffleMapTask.scala:79)
    at org.apache.spark.scheduler.ShuffleMapTask.runTask(ShuffleMapTask.scala:47)
    at org.apache.spark.scheduler.Task.run(Task.scala:86)
    at org.apache.spark.executor.Executor$TaskRunner.run(Executor.scala:274)
    at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(ThreadPoolExecutor.java:1142)
    at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(ThreadPoolExecutor.java:617)
    at java.lang.Thread.run(Thread.java:745)

这是我想出来的:

  • 本地工作:-):我在本地复制了一些相同格式的数据,可以正常查询。
  • 避免选择 event_date 有效:-):选择所有 50 多列但 event_date 不会导致任何错误。
  • 显式读取路径抛出错误 :-(:将读取路径更改为 's3a://mybucket/mykey/*/*.gz.parquet' 仍然抛出错误。
  • 指定架构仍然会引发错误 :-(:在加载之前指定架构仍然会导致相同的错误。
  • 我可以将包括eastern_date 在内的数据加载到数据仓库中:-)。

这真的很奇怪,这只会导致 DateType 列的错误。我没有任何其他 DateType 列。

使用 Spark 2.0.2 和 EMR 5.2.0。

【问题讨论】:

  • 有一个 decodeToInt 抛出错误。您提到指定架构仍然会引发错误。您提供的架构中的类型是什么?您是否尝试过将类型指定为字符串,然后在获得数据框后对其进行转换?
  • 我将其指定为 DateType。我将尝试指定为 StringType。
  • 您的本地系统和服务器的日期格式是否匹配?
  • 我在读取存储为parquetparquet 文件的(partitioned)表时遇到此错误,尽管只有 integer & 字符串类型列(Spark 2.3.0Scala 2.11.11EMR 5.13.0
  • @y2k-shubham 你有没有想过?我还读了一个分区表,我所有的列名都是字符串,我仍然得到这个错误。

标签: python apache-spark amazon-s3 pyspark parquet


【解决方案1】:

我在写 parquet 时只是使用了 StringType 而不是 DateType。没有问题了。

【讨论】:

    【解决方案2】:

    当 Spark 读取从 JSON 文件生成的 Parquet 文件时,我遇到了这个异常。

    TLDR:如果可能,使用强制应用的预期模式重写输入 Parquet。

    Scala 代码如下。 Python 不会有太大的不同。

    这就是我的 Parquet 一代最初的样子:

    spark.read
      .format("json")
      .load("<path-to-json-file>.json")
      .write
      .parquet("<path-to-output-directory>")
    

    但是会读取上述 Parquet 的 Spark 作业正在对输入执行模式。大概是这样的:

    val structType: StructType = StructType(fields = Seq(...))
    spark.read.schema(structType) 
    

    以上是异常基本发生的地方。

    修复: 为了修复异常,我必须强制将模式应用于我生成的数据:

    spark.read
      .schema(structType) // <===
      .format("json")
      .load("<path-to-json-file>.json")
      .write
      .parquet("<path-to-output-directory>")
    

    据我了解,在我的案例中出现异常的原因不是(仅)String-Type->DateType 转换,例如 @kamil-sindi。

    但事实上,在读取 JSON 时,Spark 会将 LongType 分配给所有数值。因此,我的 Parquet 将与 LongType 字段一起保存。

    读到 Parquet 的 Spark 作业大概很难将 LongType 转换为 IntegerType

    【讨论】:

      【解决方案3】:

      我知道我迟到了……

      我遇到了类似的问题。我阅读了几个 parquet 目录,将它们合并,然后尝试编写。

      我的解决方法是在写入之前添加一个 .select(...)。

      【讨论】:

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