【问题标题】:Packages Not Found Error: Not available from current channel- Bioconda未找到包裹错误:当前频道不可用 - Bioconda
【发布时间】:2022-06-18 10:27:08
【问题描述】:

使用带有 M1 芯片的 Mac,我正在尝试安装以下 Bioconda 软件包:

cutadapt  
trim-galore  
samtools  
bedtools.  
htseq.   
bowtie2.    
deeptools.  
macs2

我已经能够安装 picardfastqc 没有任何问题,但所有其他人都会出现以下两个错误消息之一:

PackagesNotFoundError: The following packages are not available from current channels:

Found conflicts! Looking for incompatible packages.
This can take several minutes.  Press CTRL-C to abort.
failed                                                                          

UnsatisfiableError:

我确实有正确的频道:

conda config --show channels 
channels:
  - conda-forge
  - bioconda
  - defaults

不知道如何解决这个问题

【问题讨论】:

  • 你是如何安装 Conda 的? Bioconda 还不支持原生 M1,所以如果想使用它,你需要安装一个 osx-64 Miniforge 构建并在 x86_64 仿真模式下运行它(通过 Rosetta2)。

标签: python installation conda


【解决方案1】:

我遇到了同样的问题并解决了这个问题:

  1. 通过在命令行中键入以下内容来安装 Rosetta2:

软件更新 --install-rosetta

  1. 下载 x86-64 位版本的 miniconda 而不是 M1 版本

【讨论】:

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