【发布时间】:2022-06-18 10:27:08
【问题描述】:
使用带有 M1 芯片的 Mac,我正在尝试安装以下 Bioconda 软件包:
cutadapt
trim-galore
samtools
bedtools.
htseq.
bowtie2.
deeptools.
macs2
我已经能够安装 picard 和 fastqc 没有任何问题,但所有其他人都会出现以下两个错误消息之一:
PackagesNotFoundError: The following packages are not available from current channels:
或
Found conflicts! Looking for incompatible packages.
This can take several minutes. Press CTRL-C to abort.
failed
UnsatisfiableError:
我确实有正确的频道:
conda config --show channels
channels:
- conda-forge
- bioconda
- defaults
不知道如何解决这个问题
【问题讨论】:
-
你是如何安装 Conda 的? Bioconda 还不支持原生 M1,所以如果想使用它,你需要安装一个
osx-64Miniforge 构建并在 x86_64 仿真模式下运行它(通过 Rosetta2)。
标签: python installation conda