使用 Plotly 将点绘制为 3D 球体答案

【问题标题】：Plotting points as 3D spheres using Plotly使用 Plotly 将点绘制为 3D 球体
【发布时间】：2022-06-18 01:46:55
【问题描述】：

我有表格形式的数据，我希望将其绘制为 3D 球体 - 其中点代表半径为 r = 点值的球体。
例如：point=4.7 --> 半径为 4.7 的球体

例子：

表 1 将产生 15 个球体，例如高度 z=1：

1	2	3	4	5
4.5	4.9	4.9	4.9	4.7
4.5	4.8	4.8	4.8	4.8
4.3	4.7	4.7	4.9	4.9

表 2 将导致另外 15 个球体“向上”移动，例如高度 z=2：

1	2	3	4	5
4.3	4.7	4.7	4.9	4.7
4.4	4.8	4.8	4.8	4.7
4.5	4.9	4.9	4.9	4.8

【问题讨论】：

欢迎来到 Stack Overflow，这个问题缺少一些细节 - 请包含一些代码，这些代码是您的问题的 minimum reproducible example
您好，感谢您的编辑。我真的没有一个“可重现”的例子，因为我首先试图找出产生情节本身的方法。

标签： python plotly-python

【解决方案1】：

我最终能够弄清楚这一点，关键思想是使用marker 参数，而该参数又具有size 属性（参考：plotly documentation）

示例代码：

使用 Pandas to_numpy() 方法将数据帧转换为 numpy 数组列表，然后使用 NumPy flatten() 方法展平每个数组。
例如：arrList.append(df.iloc[0:5,:].to_numpy().flatten())。
注意：我的数据还包含“-”形式的空格。

arrList =
[array([2.5, 2.7, 3.9, 3.8, 3.9, 2.6, 2.5, 2.5, 3.9, 3.7, 2.4, 2.6, 2.4, 4,
        3.9, 2.5, 2.3, 2.3, 3.9, 3.7, 3.8, 3.9, 3.6, 3.7, 3.8, 3.7, 3.7,
        3.7, 3.8, 3.9], dtype=object),
 array([3.8, 3.9, 2.7, 3, 2.6, 3.9, 3.3, 2.9, 2.7, 3.8, 4, 3.6, 3.9, 3.8,
        3.9, 3.7, 3.8, 4, 3.9, 3.6, 3.8, 3.9, '-', '-', '-', 3.9, 3.9, '-',
        '-', '-'], dtype=object)]

由于size 属性以像素为单位分配大小，我已经定义了一种方法来将像素“增加”x 倍（在我的情况下为 3 倍），用于我的数据中的浮点和/或整数值

def sizeMask(s):
    sphereSize = lambda s: s if isinstance(s, float) else s if isinstance(s, int) else 0.0
    vec_sphereSize = np.vectorize(sphereSize)
    return vec_sphereSize(s)

sizeList = [sizeMask(arr)*3.0 for arr in arrList]
sizeList =
[array([ 7.5,  8.1, 11.7, 11.4, 11.7,  7.8,  7.5,  7.5, 11.7, 11.1,  7.2,
         7.8,  7.2, 12. , 11.7,  7.5,  6.9,  6.9, 11.7, 11.1, 11.4, 11.7,
        10.8, 11.1, 11.4, 11.1, 11.1, 11.1, 11.4, 11.7]),
 array([11.4, 11.7,  8.1,  9. ,  7.8, 11.7,  9.9,  8.7,  8.1, 11.4, 12. ,
        10.8, 11.7, 11.4, 11.7, 11.1, 11.4, 12. , 11.7, 10.8, 11.4, 11.7,
         0. ,  0. ,  0. , 11.7, 11.7,  0. ,  0. ,  0. ])]

最后生成的情节如下：

x = np.asarray([[i]*5 for i in range(1,7)]).flatten()
y = np.asarray([np.arange(1,6)]*6).flatten()

data=[]
for i,arr in enumerate(arrList):
    data.append(go.Scatter3d(x=x, y=y,
                             z=np.asarray([i+1]*30),
                             mode='markers',
                             marker=dict(size=sizeList[i], showscale=False)))
    
fig = go.Figure(data=data)
fig.show()

【讨论】：