如何使用单个命令重新创建 Conda 环境

Question

我必须同时使用 Conda 和 pip，因为我需要的一些包只能通过 Conda 获得，而其他包只能通过 PyPI 获得。

我正在仔细关注this guide，以免我的环境处于损坏状态。

请注意以下摘录：

在 pip 之后运行 conda 可能会覆盖并可能 中断通过 pip 安装的软件包。同样，pip 可能会升级或删除 conda 安装包需要的包。

为所需的所有其他软件创建 conda 包是一个 构建数据科学环境的可靠安全方法 但如果环境涉及大量 仅在 PyPI 上可用的软件包。在这些情况下，使用 pip 只有在通过 conda 安装了所有其他要求之后 最安全的做法。

只有在使用 conda 安装尽可能多的包之后 应该使用 pip 来安装任何剩余的软件。 如果 需要对环境进行修改，最好创建一个 新环境，而不是在 pip 之后运行 conda。

因此，我经常需要删除并重新创建我的 Conda 环境。

这是我的做法：

# Dump the environment to a file
$ conda env export > environment.yml

# Deactivate the environment, so it becomes deletable
$ conda deactivate

# Delete the environment
$ conda env remove -n my-env

# Recreate the environment from the file
$ conda env create -f environment.yml -v

# Activate the new environment
$ conda activate my-env

有没有更简单的方法来使用 one 命令完成所有这些操作？

我想我可以编写一个 shell 脚本，但有些命令需要任意时间才能完成，而且我不知道如何正确计时。

像conda env recreate 这样的东西是理想的。

Answer 1

您可以通过先克隆环境然后添加顺序命令行来实现此目的：

conda create --name new_env_name --clone old_env_name && conda remove --name old_env_name --all

这里的&& 表示第二个命令（删除旧环境）只有在第一个退出并返回代码成功时才会运行

如果您绝对需要保持相同的环境名称，请这样做：

conda create --name env_name2 --clone env_name && conda remove --name env_name --all && conda create --name env_name --clone env_name2 && conda remove --name env_name2 --all

所以，基本上你将它克隆为另一个名称 (2)，删除旧的 env，将新的重新克隆为以前的名称，删除到以前的克隆 (2)，完成！

Answer 2

我通过写一个shell脚本conda_env_recreate.sh解决了这个问题：

#!/usr/bin/env zsh

env_file='environment.yml'
env_name='my-env'

echo 'Dumping Conda environment to file.'
conda env export --name $env_name > 'new_'$env_file

echo 'Deactivating Conda environment.'
conda deactivate

echo 'Deleting Conda environment.'
conda env remove -n $env_name

echo 'Recreating Conda environment from file.'
conda env create -f $env_file -v

echo 'Reactivating Conda environment.'
conda activate $env_name

然后我像这样运行它：

source conda_env_recreate.sh