R中是否有用于对象关系映射的包？答案

【问题标题】：Is there a package for object-relational mapping in R?R中是否有用于对象关系映射的包？
【发布时间】：2012-08-12 20:27:44
【问题描述】：

（通过对象关系映射，我的意思是这里描述的内容：Wikipedia: Object-relational mapping。）

我可以这样想象 R 中的这项工作：一种“虚拟数据框”链接到数据库，并在访问时返回 SQL 查询的结果。例如，head(virtual_list) 实际上会返回映射数据库上(select * from mapped_table limit 5) 的结果。

我找到了这个post by John Myles White，但过去 3 年似乎没有任何进展。

是否有实现此功能的工作包？

如果没有，

有用吗？
实现它的最佳方法是什么（S4？）？

【问题讨论】：

Oracle 有一个产品可以在 R...

标签： r orm dplyr rmysql

【解决方案1】：

看起来约翰·迈尔斯·怀特已经放弃了。

here 解释了一些解决方法。

【讨论】：

【解决方案2】：

有一个旧的不受支持的软件包 SQLiteDF 可以做到这一点。从源代码构建它并忽略大量错误消息。

> # from example(sqlite.data.frame)
>
> library(SQLiteDF)
> iris.sdf <- sqlite.data.frame(iris)
> iris.sdf$Petal.Length[1:10] # $ done via SQL
 [1] 1.4 1.4 1.3 1.5 1.4 1.7 1.4 1.5 1.4 1.5

【讨论】：

【解决方案3】：

我不认为它会有用。 R 不是真正的 OOP 语言。 R 中的“中心”数据结构是数据帧。这里不需要对象关系映射。你想要的是 SQL 表和数据帧之间的映射，而 RMySQL 和 RODBC 提供了这样的映射：

dbGetQuery 在数据框中返回查询结果，dbWriteTable 在表中插入数据或进行批量更新（从数据框）。

【讨论】：

我不同意这种观点：没有任何有用的语言是“纯粹”的任何特定类型的。 R 声称是一种函数式语言，但它也允许许多副作用。 R 应该有办法创建一个 ORM，我很高兴dplyr 加紧了。

【解决方案4】：

作为一个有经验的 R 用户，我不会使用这个。首先，这个“虚拟框架”使用起来会很慢，因为您经常需要在 R 内存和数据库之间进行同步。它还需要锁定数据库表，否则会由于同时发生其他编辑而导致无法预测的结果。

最后，我认为 R 不适合对 promise 对象进行不同的评估。执行 myFrame$foo[ myFrame$foo > 40 ] 仍将获取完整的 foo 列，因为您无法实现从 R 到 SQL 的完整转换方案。

因此，我更喜欢从查询中加载 dataframe()，使用它，并在需要时将其写回数据库。

【讨论】：

感谢您的回答。我同意内存和锁定。这可能是一个问题，具体取决于项目。关于行选择的例子：一个完整的翻译方案可能是不可能的，但至少很多常见的操作应该是可行的（例如，例子中的行选择是微不足道的）......
行选择示例对您来说是微不足道的。让我们更进一步：前 10% 的百分位数？随机 n=100 采样？等等……在实践中，很快就达到了极限。

【解决方案5】：

最近的包dplyr 正在实现这一点（以及其他惊人的功能）。

以下是函数src_mysql()的示例说明：

# Connection basics ---------------------------------------------------------
# To connect to a database first create a src:
my_db <- src_mysql(host = "blah.com", user = "hadley",
  password = "pass")
# Then reference a tbl within that src
my_tbl <- tbl(my_db, "my_table")

# Methods -------------------------------------------------------------------
batting <- tbl(lahman_mysql(), "Batting")
dim(batting)
colnames(batting)
head(batting)

【讨论】：

dplyr 不支持将对象持久化到数据库中（您仍然需要编写 INSERT INTO 语句）。有办法做到这一点，但不推荐：stackoverflow.com/a/26784801/3910619
这不是 ORM 方法。这只是从数据库中拉出一个表并将其转换为 data.frame/tbl。适当的 ORM 将数据库的条目（包括它们的关系）映射到编程语言中的对象/类。

【解决方案6】：

在用于查询 DB 的各种驱动程序包旁边（DBI、RODBC、RJDBC、RMySql...）还有dplyr，还有sqldfhttps://cran.r-project.org/web/packages/sqldf/

这将自动将数据帧导入数据库并让您通过 sql 查询数据。最后数据库被删除。

【讨论】：