ImageJ 宏不释放内存资源

Question

我正在使用 ImageJ v1.49e（附带 java 1.6.0_24 (64bit)）

我编写了一个宏，它从输入目录读取图像，进行一些处理并根据条件将图像移动到输出目录。以批处理模式运行，因为我希望处理 100,000 张图像。

因此，我从 ImageJ 运行宏，并通过 JConsole 监控内存使用情况，我只看到内存使用情况不断上升，再也没有回落。 ImageJ 分配了 6GB，但很快它就达到了这个限制。即使我从 JConsole 或宏中调用 GC，它什么也不做。

我检查以确保我在批处理模式下运行并关闭我打开的任何窗口，但仍然不行。在网上也找不到任何关于为什么会发生这种情况的信息。

我没有正确释放我的资源吗？ 我有什么遗漏吗？

下面是宏代码

inputDir = getDirectory("Choose the Input Directory");
outputDir = getDirectory("Choose the Output Directory");

inputDir = replace(inputDir,"\\\\", "\\\\\\\\");
outputDir = replace(outputDir,"\\\\", "\\\\\\\\");

if(inputDir != "" || outputDir != "") {
    setBatchMode(true);
    analyzeImagesBatch(inputDir, outputDir);
    exit("Done");
}
else {
    exit("Must select an input and output directory");
}

function analyzeImagesBatch(inputDir, outputDir) {
    inputList = getFileList(inputDir);

    for (i=0; i < inputList.length; i++) {
        showProgress(i+1, inputList.length);
        fileName = inputList[i];
        ok = imageAnalysis(inputDir, outputDir, fileName, 50, 30, 20);
        if(ok != 1) {
            imageAnalysis(inputDir, outputDir, fileName, 5, 10, 10);
        }
    }
}

function imageAnalysis(inputDir, outputDir, fileName, backgroundValue, size, countThresh) {
    ok = 0;
    open(inputDir+fileName);
    imageId = getImageID();
    run("8-bit");
    run("Subtract Background...", "rolling="+backgroundValue);  
    setAutoThreshold("Default");
    setOption("BlackBackground", false);
    run("Convert to Mask");
    run("Analyze Particles...", "size="+size+"-Infinity circularity=0.40-1.00 exclude clear");

    count = nResults();
    if(count >= countThresh) {
        ok = File.rename(inputDir+fileName, outputDir+fileName);
    }

    selectImage(imageId);
    close();
    return ok;
}

Answer 1

我将宏重写为 Java 插件，并在同一组 100,000 张图像上运行它。内存使用量保持在 70mb 以下。

使用 IJ 宏时肯定是内存泄漏。