从 R Markdown 修改 .bib 文件

Question

在下面的示例中，我从一大段代码生成包的参考书目。但是，一个包的 BibTeX 条目中存在错误。我可以手动修改此条目，但我的更改将在下次编织文件时被覆盖。

所以我想知道是否可以从R Markdown中的一个chunk修改.bib文件中的行，这样每次编织文件时都会自动更正条目。

例子：

---
title: "Cite R packages"
author: ''
date: ""
output:
  pdf_document
bibliography: mistakeref.bib
---

```{r echo=FALSE}
# If not installed yet: 
# install.packages("cem")
```

This is a citation of a paper: @R-cem 

```{r cite-packages, echo=FALSE}
knitr::write_bib("cem", file = "mistakeref.bib", tweak = TRUE)
```

mistakeref.bib 将由代码创建，但在包cem 的 Bibtex 条目中存在错误。我想更换：

author = {{Iacus} and Stefano M. and {King} and {Gary} and {Porro} and {Giuseppe}},

作者：

author = {Stefano M. Iacus and Gary King and Giuseppe Porro},

基本上，这将是 R 的一种自动“搜索和替换”。我在理解 this answer 时遇到了一些麻烦，我不确定它是否符合我想做的事情。

Answer 1

使用readLines 读入.bib 文件。然后使用grep 来识别“坏”行（. 是一个特殊字符，所以我们需要使用\\. 进行转义）。然后使用cat 替换并保存。

l <- readLines("mybib.bib")
l[grep("Stefano M\\.", l)] <- 
  "  author = {Stefano M. Iacus and Gary King and Giuseppe Porro},"
cat(l, sep="\n", file="mybib1.bib")

只需扩展 grep 正则表达式，直到有一个匹配项。