【问题标题】:Meta-analysis using metafor package in R: back-transforming for funnel plot X-axis在 R 中使用 metafor 包进行元分析:漏斗图 X 轴的反向转换
【发布时间】:2016-08-27 04:03:51
【问题描述】:

我正在使用 R 中的 metafor 包进行元分析,并使用 funnel() 函数创建标准漏斗图。

我的效果大小是相关性,我通过 rma() 中的 measure="ZCOR" 参数将它们转换为 Z 分数,以进行组合,然后进行反向转换以进行报告。

我有兴趣在漏斗图中展示原始相关性。我很确定我需要使用来自funnel()atransf= 参数来执行此操作,但我找不到合适的反向转换来提供原始相关性而不是转换后的相关性。

不久前,我在 R-help 档案中看到了我的确切问题,不幸的是,我又找不到它了; GMane 档案似乎不起作用,至少对我来说是这样。如果这个答案很容易在网上某处找到,我们深表歉意;到目前为止,我已经搜索了 JSS metafor 文章、包文档和包网站,但没有成功。我想一个相关的问题是:transfatransf 参数的所有可能值是否有一个主列表?

这里是生成漏斗图的示例代码,其中 X 轴上的转换值。我正在寻找未转换值的显示。

library(metafor)
mydat <- data.frame(raw_corrs = c(.22,.35,.01,-.05,.16), 
    N =c(50,70,90,130,20))
model1 <- rma(ri=raw_corrs, ni=N, data=mydat, measure="ZCOR")
funnel(model1)

【问题讨论】:

  • 抱歉错过了这个---添加了可重现的例子。

标签: r data-visualization


【解决方案1】:

metafor 的包文档在transf 主题下提供了有用的转换函数列表。请注意,transfatransf 参数实际上将接受任何有效函数。

在您的情况下,您正在使用 Fisher 的 r-to-z 变换进行相关性,因此可以通过设置 atransf = transf.ztor 来实现适当的反向变换

【讨论】:

  • 天哪,我不敢相信我在包装文档中错过了这一点。非常感谢您的帮助。
  • 这样的事情很高兴知道。我刚刚改进了文档,其中包含指向具有transf 和/或atransf 参数的任何函数的所有这些转换函数的帮助页面的链接。现在已经在“开发”版本中 (metafor-project.org/doku.php/installation#development_version)。
  • 感谢@Wolfgang,非常感谢您为创建和维护metafor所做的所有工作!
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