是否有 R 函数可以帮助我修改巴黎图中散点图的大小？

Question

我使用pairs(fit, pars = c("mu", "sigma", "lambda"), include = TRUE) 在我的 stan 模型的每对变量之间创建直方图和散点图。现在散点图中的点非常大，像这样：

我想让点更小更清晰，如果可能的话，我还想改变情节的颜色。有没有可以帮助我做到这一点的 R 函数？谢谢！

Answer 1

如果你只是想绘制点，可以通过指定自定义函数来完成：

library(rstan)
example(read_stan_csv)
pairs(fit, pars = c("mu", "sigma", "alpha"), log = TRUE,
panel=function(x,y)points(x,y,col="blue",pch=20,cex=0.6))

在panel参数下，我们指定了一个颜色为“蓝色”的点函数，cex是调整点大小的参数。

默认绘图是平滑散点图，而不是单个点，它显示数据点的密度。要更改它，您必须调用 smoothScatter 作为面板函数，并且颜色作为调色板提供。例如：

library(RColorBrewer)
PAL = colorRampPalette(c("white",brewer.pal(6,"Greens")))

pairs(fit, pars = c("mu", "sigma", "alpha"), log = TRUE,
panel=function(x,y){smoothScatter(x,y,add=T,colramp = PAL,cex=2)})

如前所述，它不是散点图，因此您可以看到 cex 几乎没有效果。阅读source code，请注意在某些情况下，上面的这个函数可能会在绘制的点数上有所不同。所以你应该只指定你用上面的函数绘制的内容，而不是假设它等同于 pair.stanfit () 函数。