来自非常简单的示例 fortran 代码的 MPI 错误答案

【问题标题】：MPI error from very simple example fortran code来自非常简单的示例 fortran 代码的 MPI 错误
【发布时间】：2020-11-25 01:36:29
【问题描述】：

我已经编译了这段代码：

 program mpisimple
  
  implicit none
  
  integer ierr

  include 'mpif.h'

  call mpi_init(ierr)

  write(6,*) 'Hello World!'

  call mpi_finalize(ierr)

  end

使用命令：mpif90 -o helloworld simplempi.f90

当我使用这个命令运行时：

    $ mpiexec -np 1 ./helloworld
    Hello World!

如您所见，它运行良好。但是当我使用任何其他数量的处理器（这里是 4 个）运行时，我得到了错误，我基本上必须 ctrl+C 来杀死它。

Fatal error in MPI_Init: Other MPI error, error stack:
MPIR_Init_thread(805).....: fail failed
MPID_Init(1859)...........: channel initialization failed
MPIDI_CH3_Init(126).......: fail failed
MPID_nem_init_ckpt(858)...: fail failed
MPIDI_CH3I_Seg_commit(427): PMI_KVS_Get returned 4
In: PMI_Abort(69777679, Fatal error in MPI_Init: Other MPI error, error stack:
MPIR_Init_thread(805).....: fail failed
MPID_Init(1859)...........: channel initialization failed
MPIDI_CH3_Init(126).......: fail failed
MPID_nem_init_ckpt(858)...: fail failed
MPIDI_CH3I_Seg_commit(427): PMI_KVS_Get returned 4)
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred

可能是什么问题？我在 Linux hpc 系统上执行此操作。

【问题讨论】：

标签： mpi

【解决方案1】：

我知道为什么会这样了。我正在使用的系统不需要用户通过调度程序提交单核作业，但对于多核作业确实需要它。一旦通过 PBS bash 脚本提交了 mpiexec 命令，错误就消失了，并且输出如预期的那样。

【讨论】：

您可能在集群的头节点上设置了非常低的资源限制。 ulimit -a 显示它们。这通常是为了防止人们使用多核作业使头节点超载。