【问题标题】:MPI_Isend/MPI_Recv vs. MPI_Send/MPI_IrecvMPI_Isend/MPI_Recv 与 MPI_Send/MPI_Irecv
【发布时间】:2022-02-07 01:54:26
【问题描述】:

对于 MPI 中的异步通信,以下哪个更好(在性能、可靠性、可读性等方面):

  • MPI_Isend 与缓冲区,然后 MPI_Iprobe & MPI_Recv 一旦接收器准备好,或
  • MPI_Irecv 带缓冲区(这样总是有足够的缓冲区发布 MPI_Irecv),然后 MPI_Send 发送者准备好?

通信场景是数据必须异步交换,到达时间无关紧要,两个进程都有工作量。只考虑整体性能(尤其是无阻塞)。

下面是一个最小的工作示例(我没有包括工作量,因此时间可能没有意义)。

#include <mpi.h>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <unistd.h>

int main(int argc, char const *argv[]) {
  MPI_Init(NULL, NULL);
  int world_size, world_rank;

  MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &world_size);
  MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &world_rank);

  if (world_rank == 0 && world_size != 2) {
    fprintf(stderr, "This example requires two MPI processes.\n");
    MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, EXIT_FAILURE);
  }

  /* Non Blocking Send */
  int buf[100] = {0};

  MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);
  double time = MPI_Wtime();
  if (world_rank == 1) {
    MPI_Request request;
    MPI_Isend(buf, 100, MPI_INT, 0, 0, MPI_COMM_WORLD, &request);
    MPI_Wait(&request, MPI_STATUS_IGNORE);
  } else {
    MPI_Recv(buf, 100, MPI_INT, 1, 0, MPI_COMM_WORLD, MPI_STATUS_IGNORE);
  }
  time = MPI_Wtime() - time;
  printf("rank = %d, time = %f sec\n", world_rank, time);
  MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);

  usleep(100);
  if (world_rank == 0) {
    printf("---\n");
  }

  /* Non Blocking Receive */
  MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);
  time = MPI_Wtime();
  if (world_rank == 1) {
    MPI_Send(buf, 100, MPI_INT, 0, 0, MPI_COMM_WORLD);
  } else {
    MPI_Request request;
    MPI_Irecv(buf, 100, MPI_INT, 1, 0, MPI_COMM_WORLD, &request);
    MPI_Wait(&request, MPI_STATUS_IGNORE);
  }
  time = MPI_Wtime() - time;
  printf("rank = %d, time = %f sec\n", world_rank, time);
  MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);

  MPI_Finalize();
  return 0;
}

在我的机器上生成:

rank = 0, time = 0.000035 sec
rank = 1, time = 0.000036 sec
---
rank = 0, time = 0.000035 sec
rank = 1, time = 0.000026 sec

已经感谢您的回答,祝您有愉快的一天:)

【问题讨论】:

  • 后者避免了意外消息(这可能导致内存使用量增加)。另外,请记住MPI_Send() 可能会阻止如果没有发布匹配的接收。这是选择第二个选项的两个原因。

标签: mpi


【解决方案1】:

一般的经验法则是:

  1. 在缓冲区中接收数据。此操作很快,但您可能会等待消息到达,
  2. 发送一些数据,再次在缓冲区中;这是一个漫长的步骤。

反过来做也不错,但是可以更好地重叠发送和接收。

因此,应该选择您描述的第二种情况。此外,如果您不使用非阻塞通信,请注意死锁。有关死锁,请参阅MPI Send and receive questions。

读者练习:

在以下片段中,假设所有缓冲区都已分配足够的大小。此外,rank 和 size 分别表示每个进程的排名和 MPI 进程的总数。 对于每个片段,请注意它是否死锁并解释原因。报告性能问题。

sn-p 1:

int ireq = 0;
for (int p=0; p<size; p++)
if (p!=rank)
MPI_Isend(sbuffers[p],buflen,MPI_INT,p,0,comm,&(reqs[ireq++]));
for (int p=0; p<size; p++)
if (p!=rank)
MPI_Recv(rbuffer,buflen,MPI_INT,p,0,comm,MPI_STATUS_IGNORE);
MPI_Waitall(size-1,reqs,MPI_STATUSES_IGNORE);

sn-p 2:

int ireq = 0;
for (int p=0; p<size; p++)
if (p!=rank)
MPI_Irecv(rbuffers[p],buflen,MPI_INT,p,0,comm,&(reqs[ireq++]));
MPI_Waitall(size-1,reqs,MPI_STATUSES_IGNORE);
for (int p=0; p<size; p++)
if (p!=rank)
MPI_Send(sbuffer,buflen,MPI_INT,p,0,comm);

解决方案:

sn-p 1 出现性能问题,反转接收并发送。

sn-p 2 由于 Waitall 导致死锁。

【讨论】:

    猜你喜欢
    • 2015-05-27
    • 2020-03-09
    • 2011-11-11
    • 2018-05-29
    • 2016-04-22
    • 2014-04-17
    • 2011-01-24
    • 2016-09-09
    • 2017-10-25
    相关资源
    最近更新 更多