如何同时使用intel parallel studio 和openmpi？答案

【问题标题】：How to use intel parallel studio and openmpi at the same time?如何同时使用intel parallel studio 和openmpi？
【发布时间】：2017-06-20 09:27:54
【问题描述】：

在 ubuntu 中，默认的 mpirun 是 openmpi，如

所示

mpirun --version
mpirun (Open MPI) 1.10.2

但是在安装 intel parallel studio 之后，在~/.bashrc 中添加以下几行

. /opt/intel/parallel_studio_xe_2017.4.056/psxevars.sh intel64

mpirun 变成了

mpirun --version
Intel(R) MPI Library for Linux* OS, Version 2017 Update 3 Build 20170405 (id: 17193)
Copyright (C) 2003-2017, Intel Corporation. All rights reserved.

但是如果我想使用 intel ifort 而使用 openmpi 怎么办？如何设置？

【问题讨论】：

标签： mpi intel

【解决方案1】：

我假设 ubuntu 上的默认 MPI 是使用 GNU 编译器编译的 Open MPI。 GNU 和 Intel Fortran 编译器之间没有二进制兼容性，因此您必须使用 ifort 重建 Open MPI 然后你必须在$PATH 和$LD_LIBRARY_PATH 前面加上安装路径。

【讨论】：

嗨，@Gilles Gouaillardet。非常感谢您的回答。我试过你的方法。用intel构建openmpi，然后在bashrc中添加path和ld_library_path，但是mpirun --version还是显示intel
“哪个 mpirun”说什么？您需要将新位置添加到您的环境中，导出变量（“export”或“setenv”），您可能还需要“rehash”
哦，你是对的。我设置了错误的路径。现在它起作用了。但是有一个新问题。我必须链接scalapack，所以我根据链接顾问添加-lmkl_scalapack_lp64 -lmkl_blacs_openmpi_lp64。但是我得到了一堆 ompi_mpi_xxxx 未定义的引用，怎么了？
确保 mkl 库在 mpi 库之前。我假设您使用 mpif90 或 mpifort 来链接您的应用程序，因此您可以“mpifort --showme ...”来获取完整的命令行。它应该类似于“-lmkl_scalapack_lp64 -lmkl_blacs_openmpi_lp64 -lmpi”