Python / networkx：创建笔记属性异常失败

Question

我看到了一种让我发疯但我不理解的效果： 我正在从 6 列 SQL Server 2012 数据库表（nodeID、string(Class)、float(xCoordinate)、float(ycoordinate)、stringZone、char(Reference)）中获取数据，我想使用这些实体创建网络图networkx Python 包。对我来说重要的是，我确实有几个具有预定义坐标的网络节点，我想稍后保持固定，其余部分将使用 Gephi 进行布局。

这是我的代码：

import pyodbc
import networkx as nx

dbConnection = pyodbc.connect('DB-Connection String')
dbCursor = dbConnection.cursor()

theGraph = nx.Graph()
theGraph.position={}
theGraph.deviceClass={}

queryStatement = "SELECT ComponentID, DeviceClass, CoordX, CoordY, AcceleratorZone, Reference FROM dbo.vComponentsWithZones WHERE Reference IN ('M','T')"
for dbRow in dbCursor.execute(queryStatement):
    nodeID = dbRow[0]
    theGraph.add_node(nodeID)

    deviceClass = dbRow[1]
    coordX = (dbRow[2] - 367421.373) / 100
    coordY = (dbRow[3] - 230238.784) / 100
    accelZone = dbRow[4]

    if coordX != None and coordY != None:
        print nodeID, coordX, coordY   <-------------------------
        theGraph.node[nodeID]["viz"] = {'position': {'x': coordX, 'y': coordY, 'z': 0}}

    if accelZone != None:
        theGraph.node[nodeID]["AccelZone"] = accelZone
    if dbRow[1] != None:
        theGraph.node[nodeID]["DeviceClass"] = deviceClass 

    if deviceClass == "Controls":
        theGraph.node[nodeID]["viz"] = {'color': {'r': "255", 'g': "0", 'b': "0", 'a': "1"}}
    elif deviceClass == "Magnet":
        theGraph.node[nodeID]["viz"] = {'color': {'r': "255", 'g': "200", 'b': "0", 'a': "1"}}
    elif deviceClass == "Vacuum":
        theGraph.node[nodeID]["viz"] = {'color': {'r': "0", 'g': "0", 'b': "255", 'a': "1"}}

queryStatement = "SELECT * FROM dbo.ComponentConnections"
for dbRow in dbCursor.execute(queryStatement):
    theGraph.add_edge(dbRow[0],dbRow[1], connectionTyp=dbRow[2])

dbConnection.close()

nx.write_gexf(theGraph,"cryringTopology.gexf")

一切似乎都运行良好，查看 print 语句的输出，一切似乎也运行良好；我确实得到了 nodeID、coordX、coordY 的值，只要数据库中有一个条目，程序就会评估语句

if coordX != None and coordY != None:

true 并正确执行其中的代码。

Screenshot of print output

但是，GEXF 文件的输出仅生成正确分配坐标的 6 个条目，其中应该是 40 - 50。似乎在某些情况下创建“位置”节点属性会失败，我完全迷路了。

有什么想法吗？？？

Answer 1

你在这一行中存储的内容

theGraph.node[nodeID]["viz"] = {'position': {'x': coordX, 'y': coordY, 'z': 0}}

被这些行覆盖

theGraph.node[nodeID]["viz"] = {'color': {'r': "255", 'g': "0", 'b': "0", 'a': "1"}}