R：plot.window(...) 中的错误：需要有限的 'ylim' 值

Question

我正在使用 R。我正在尝试在此处遵循以前的 stackoverflow 帖子中的代码：Kullback-Leibler distance between 2 samples

特别是，我试图确定两个数据集之间的“距离”：

#load library
library(FNN)
library(dplyr)

#create two data sets
df = iris
data1 = sample_n(df, 20)
data2 = sample_n(df, 20)

#plot KL divergence
plot(KLx.dist(data1,data2))

但是，这会产生以下错误：

Error in plot.window(...) : need finite 'ylim' values
In addition: Warning messages:
1: In min(x) : no non-missing arguments to min; returning Inf
2: In max(x) : no non-missing arguments to max; returning -Inf

有谁知道为什么会产生这个错误？

谢谢

Answer 1

根据KLx.dist 文档，此功能需要数据矩阵作为输入。在iris 数据集中，我们需要删除Species 列，它是一个factor 变量。在采样前删除Species 列将解决问题：

data(iris)

library(FNN)
library(dplyr)

#create two data sets
df = iris[,1:4]
data1 = sample_n(df, 20)
data2 = sample_n(df, 20)

#plot KL divergence
plot(KLx.dist(data1,data2))