在 RStudio 中使用行名和列名中的文本创建表答案

【问题标题】：Creating a table in RStudio with text in the row names and column names在 RStudio 中使用行名和列名中的文本创建表
【发布时间】：2018-11-24 09:03:51
【问题描述】：

我希望创建一个表格来比较 4 个不同的基因组，以查看不同基因组之间的重叠位置。我想将它们称为：

'BCG_validation'
'BCG_discovery'
'MTB_validation'
'MTB_discovery'

目前我写的代码如下：

mx.overlap <- matrix(rep(NA,16), ncol=4)
mx.overlap

colnames(mx.overlap) <- paste('BCG_validation', 'BCG_discovery',
'MTB_validation','MTB_discovery')

rownames(mx.overlap) <- paste('BCG_validation', 'BCG_discovery',       
'MTB_validation', 'MTB_discovery')

但是，当我执行它时，我收到了错误消息：

dimnames(x) 中的错误 'dimnames' [2] 的长度不等于数组范围。

关于如何更改此代码以成功创建表格的任何想法？

你可以看到 [,1] 一直到 4，这就是我希望看到标题的地方，这样当我输入“查看”时，我可以直观地看到所有行名和列名。

【问题讨论】：

使用c()，而不是paste()。 paste() 将所有 4 个标签连接成一个字符串（1 个元素），这与所需的行/列名称的数量（4 个元素）不匹配。

标签： r rstudio bioinformatics data-analysis

【解决方案1】：

错误使用?paste，使用?c

mx.overlap <- matrix(rep(NA,16), ncol=4)

colnames(mx.overlap) <- c('BCG_validation', 'BCG_discovery',
                              'MTB_validation','MTB_discovery')

rownames(mx.overlap) <- c('BCG_validation', 'BCG_discovery',       
                              'MTB_validation', 'MTB_discovery')

mx.overlap

你也可以在矩阵定义后使用?dimnames：

nm <- c('BCG_validation', 'BCG_discovery',
        'MTB_validation','MTB_discovery')

dimnames(mx.overlap) <- list(nm, nm)

甚至shorer直接在矩阵中使用dimnames =参数：

nm <- c('BCG_validation', 'BCG_discovery', 'MTB_validation', 'MTB_discovery')
mx.overlap <- matrix(rep(NA,16), ncol=4, dimnames = list(nm, nm))

【讨论】：

我刚刚尝试使用您的建议再次执行它。确实有效，非常感谢！