awk 解析输入并删除字段中的文本答案

【问题标题】：awk to parse input and remove text in fieldawk 解析输入并删除字段中的文本
【发布时间】：2015-10-17 02:13:05
【问题描述】：

尝试使用awk 解析文件但没有得到所需的输出，我似乎无法弄清楚。谢谢你:)。

input.txt

chr1    955543  955763  AGRN-6|pr=2|gc=75   0   +
chr1    957571  957852  AGRN-7|pr=3|gc=61.2 0   +
chr1    970621  970740  AGRN-8|pr=1|gc=57.1 0   +

当前输出.txt

chr1    955543  955763  AGRN-6 pr=2 gc=75   0   +

chr1    957571  957852  AGRN-7 pr=3 gc=61.2 0   +

chr1    970621  970740  AGRN-8 pr=1 gc=57.1 0   +

desired output.txt（|pr=2|gc=75 0，以及行间距）从输出中移除

chr1    955543  955763  AGRN-6  +
chr1    957571  957852  AGRN-7  +
chr1    970621  970740  AGRN-8  +

这是我尝试过的：

awk -F"[*|]" '{print $1, $2, $3, $4, $5, $6,}' input.txt > output.txt

【问题讨论】：

标签： awk

【解决方案1】：

你可以这样做：

awk -F '[[:blank:]]+|\\|' '{print $1, $2, $3, $4, $NF}'

这会为您提供所需的字段，但不会保留间距。这将：

awk '{sub(/\|[^[:blank:]]+[[:blank:]]+[0-9]+/, ""); print }' <<END
chr1    955543  955763  AGRN-6|pr=2|gc=75   0   +
chr1    957571  957852  AGRN-7|pr=3|gc=61.2 0   +
chr1    970621  970740  AGRN-8|pr=1|gc=57.1 0   +
END

chr1    955543  955763  AGRN-6   +
chr1    957571  957852  AGRN-7   +
chr1    970621  970740  AGRN-8   +

【讨论】：

【解决方案2】：

可能是最简单的解决方案：

awk -F"|" '{print $1"   +"}' input.txt > output.txt

但是，在此解决方案中，后面的“+”是手动添加的。输出：

chr1    955543  955763  AGRN-6   +
chr1    957571  957852  AGRN-7   +
chr1    970621  970740  AGRN-8   +

要不然试试

 awk -F"[| ]+" '{print $1, $2, $3, $4, $8}' input.txt > output.txt

哪个输出

chr1 955543 955763 AGRN-6 +
chr1 957571 957852 AGRN-7 +
chr1 970621 970740 AGRN-8 +

【讨论】：

【解决方案3】：

另一种选择（如果您不关心输出间距）

$ awk '{split($4,a,"|"); print $1,$2,$3,a[1],$NF}' file
chr1 955543 955763 AGRN-6 +
chr1 957571 957852 AGRN-7 +
chr1 970621 970740 AGRN-8 +

【讨论】：