“混合”操作员不等待上游进程完成答案

【问题标题】："Mix" operator does not wait for upstream processes to finish“混合”操作员不等待上游进程完成
【发布时间】：2019-01-07 20:43:19
【问题描述】：

我有几个上游进程，比如 A、B 和 C，执行类似的任务。在它的下游，我有一个进程 X 需要以相同的方式处理 A、B 和 C 的所有输出。

我尝试使用“混合”运算符从 A、B 和 C 的输出文件中创建单个通道，如下所示：

process A {
    output:
    file outA
}
process B {
    output:
    file outB
}
process C {
    output:
    file outC
}

inX = outA.mix(outB,outC)

process X {
    input:
    file inX

    "myscript.sh"
 }

进程 A 经常在 B 和 C 之前完成，不知何故，进程 X 不等待进程 B 和 C 完成，而只将 A 的输出作为输入。

【问题讨论】：

标签： nextflow

【解决方案1】：

下面的 sn-p 效果很好：

process A {
    output:
    file outA
    """
    touch outA
    """
}

process B {
    output:
    file outB
    """
    touch outB
    """

}

process C {
    output:
    file outC
    """
    touch outC
    """
}

inX = outA.mix(outB,outC)

process X {
    input:
    file inX

    "echo myscript.sh"
}

如果您继续遇到同样的问题，请随时打开issue，包括可重现的测试用例。

【讨论】：