将制表符分隔的文件一个接一个地合并，没有标题答案

【问题标题】：Merge tab delimited files one upon other without header将制表符分隔的文件一个接一个地合并，没有标题
【发布时间】：2018-05-13 20:07:08
【问题描述】：

您好，我有两个制表符分隔的文本文件

file.1.txt

Chr Start   End Ref Alt
chr1    4204560 4204560 T   C
chr1    9471179 9471181 ATA -
chr1    9471230 9471230 A   C
chr1    9471247 9471247 T   C
chr1    9471254 9471254 C   A
chr1    9471261 9471262 AA  -
chr1    9471262 9471262 A   C

AND 文件.2.txt

Chr Start   End Ref Alt
chr1    9471268 9471268 -   ACT
chr1    9471274 9471274 A   C
chr1    9471275 9471275 A   C
chr1    9471284 9471284 T   C
chr1    9471297 9471297 T   C
chr1    9471302 9471302 T   C
chr1    9471312 9471312 A   C

现在，如果我想合并这两个文件，排除第二个文件的标题行，然后将文件一个接一个地合并

Chr Start   End Ref Alt
chr1    4204560 4204560 T   C
chr1    9471179 9471181 ATA -
chr1    9471230 9471230 A   C
chr1    9471247 9471247 T   C
chr1    9471254 9471254 C   A
chr1    9471261 9471262 AA  -
chr1    9471262 9471262 A   C
chr1    9471268 9471268 -   ACT
chr1    9471274 9471274 A   C
chr1    9471275 9471275 A   C
chr1    9471284 9471284 T   C
chr1    9471297 9471297 T   C
chr1    9471302 9471302 T   C
chr1    9471312 9471312 A   C

如何使用 awk 命令或 shell 脚本来做到这一点？

附：实际文件的列数为168。

【问题讨论】：

标签： shell awk

【解决方案1】：

关注awk 也可能对您有所帮助。

awk 'FNR==NR{print;next} FNR!=NR && FNR>1{print}' file1.txt file2.txt

或者更准确地说，不需要FNR!=NR：

awk 'FNR==NR{print;next} FNR>1{print}' file1.txt file2.tx

【讨论】：

@RonicK，很高兴它对你有用。您可以通过对答案进行投票来感谢某人，并且也可以为了其他读者的利益而选择任何答案作为正确答案。

【解决方案2】：

您可以使用以下awk:

awk 'FNR > 1 || NR == 1' file1 file2

Chr Start   End Ref Alt
chr1    4204560 4204560 T   C
chr1    9471179 9471181 ATA -
chr1    9471230 9471230 A   C
chr1    9471247 9471247 T   C
chr1    9471254 9471254 C   A
chr1    9471261 9471262 AA  -
chr1    9471262 9471262 A   C
chr1    9471268 9471268 -   ACT
chr1    9471274 9471274 A   C
chr1    9471275 9471275 A   C
chr1    9471284 9471284 T   C
chr1    9471297 9471297 T   C
chr1    9471302 9471302 T   C
chr1    9471312 9471312 A   C

或者只使用cat 和tail：

cat file1; tail -n +2 file2

【讨论】：

【解决方案3】：

另一个 awk：

$ awk 'p<FNR;{p=FNR}' file1 file2

输出：

Chr Start   End Ref Alt
chr1    4204560 4204560 T   C
chr1    9471179 9471181 ATA -
chr1    9471230 9471230 A   C
chr1    9471247 9471247 T   C
chr1    9471254 9471254 C   A
chr1    9471261 9471262 AA  -
chr1    9471262 9471262 A   C
chr1    9471268 9471268 -   ACT
chr1    9471274 9471274 A   C
chr1    9471275 9471275 A   C
chr1    9471284 9471284 T   C
chr1    9471297 9471297 T   C
chr1    9471302 9471302 T   C
chr1    9471312 9471312 A   C

即。如果先前的 FNR p 小于当前的，则输出。

【讨论】：

【解决方案4】：

任何不这样做的理由：

cat file1; tail +2 file2

【讨论】：