使用 Conda Build 的 Cython Python 程序答案

【问题标题】：Cython Python Program using Conda Build使用 Conda Build 的 Cython Python 程序
【发布时间】：2014-10-25 14:43:37
【问题描述】：

我正在尝试使用“conda build fibtestpackage”命令构建一个包。

“fibtestpackage”是使用 Cython 构建的，因此在 .sh 文件中我有命令：

python setup.py build_ext --inplace

即使构建成功结束，输出也符合预期：

正在获取包... fibtestpackage-1.0.0 100% |###############################|时间：0:00:00 3.03 MB/s

正在提取包... [完成] |##################################### ############| 100%

链接包... [完成]|############################################## ####| 100%

我在 YAML 文件中的一项测试失败了。我唯一的测试是这样的：

test:
  # Python imports
  imports:
      - fibtestpackage
      #- numpy
      #- samplers

因此，这是一个导入错误，

ImportError: 没有名为 fibtestpackage 的模块

我对为什么会出现 importerror 的第一个猜测是因为构建生成的 .SO、.C 和 .PYX 文件（以及库的其他文件）没有放入 anaconda/lib/python2 中。 7/site-packages/ 其他模块所在的文件夹。我是否需要在 shell 文件中指定这一点，还是应该由“python setup.py build_ext --inplace”命令覆盖？

我的第二个猜测是发行版中有两个不同版本的 conda（更新后），

1) Python 2.7.8 |Anaconda 2.1.0（64 位）| （默认，2014 年 8 月 21 日，18:22:21）

2) Python 2.7.8 |Continuum Analytics, Inc.| （默认，2014 年 8 月 21 日，18:22:21）

这会导致问题吗？也许构建环境将库安装在错误的环境中？

提前感谢您的帮助！

【问题讨论】：

经过一番研究，我在 .sh 文件中发现如果我将构建生成的 fibstestpackage.so 文件移动（使用 cp 命令）到 ~/anaconda/lib/python2.7/site -packages/ 文件夹，它似乎工作。这是最好的解决方案吗？？？

标签： python conda cython conda-build

【解决方案1】：

Conda build 创建了一个构建 conda 环境，称为 _build（通常在 ~/anaconda/envs/_build 中），您应该在其中安装所有内容。对于 Python，如果您包括Python 作为 meta.yaml 中的构建依赖项，因为 python 将是安装在 _build 环境中的那个，它将安装在那里。

在构建结束时，conda build 会打包构建环境中的所有新文件，并从中创建一个 conda 包。如果有测试阶段，它会删除_build 环境并创建一个名为_test 的测试环境，并在那里安装和运行包。

要调试此问题，请尝试在 ~/anaconda/envs/_test 中运行 Python。

在您的情况下，问题可能是python setup.py build_ext --inplace 实际上并没有安装文件，它只是构建它们。在构建结束时检查它说有多少文件。如果有 0，那么这就是问题所在。

【讨论】：